Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MttpO08601 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MttpO08601 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MttpO08601 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MttpO08601 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MttpO08601 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MttpO08601 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MttpO08601 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MttpO08601 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MttpO08601 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MttpO08601 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MttpO08601 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MttpO08601 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MttpO08601 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MttpO08601 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MttpO08601 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MttpO08601 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MttpO08601 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MttpO08601 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MttpO08601 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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MttpO08601 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MttpO08601 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MttpO08601 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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MttpO08601 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
MttpO08601 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MttpO08601 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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MttpO08601 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MttpO08601 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MttpO08601 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MttpO08601 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MttpO08601 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MttpO08601 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MttpO08601 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MttpO08601 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MttpO08601 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MttpO08601 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MttpO08601 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MttpO08601 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MttpO08601 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MttpO08601 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MttpO08601 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MttpO08601 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MttpO08601 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MttpO08601 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MttpO08601 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MttpO08601 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MttpO08601 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MttpO08601 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MttpO08601 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MttpO08601 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
MttpO08601 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MttpO08601 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MttpO08601 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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MttpO08601 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MttpO08601 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MttpO08601 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MttpO08601 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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MttpO08601 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MttpO08601 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MttpO08601 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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MttpO08601 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MttpO08601 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MttpO08601 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MttpO08601 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MttpO08601 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
MttpO08601 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
MttpO08601 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MttpO08601 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MttpO08601 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MttpO08601 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MttpO08601 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MttpO08601 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MttpO08601 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MttpO08601 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MttpO08601 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MttpO08601 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
MttpO08601 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MttpO08601 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MttpO08601 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MttpO08601 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MttpO08601 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
MttpO08601 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
MttpO08601 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
MttpO08601 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MttpO08601 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MttpO08601 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MttpO08601 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MttpO08601 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MttpO08601 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MttpO08601 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MttpO08601 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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