Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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