Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms