Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3542K7N6U2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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