Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gm21976J3QNN2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gm21976J3QNN2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gm21976J3QNN2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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