Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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