Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm3415J3QMS8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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