Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms