Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm6176J3QK59 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6176J3QK59 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6176J3QK59 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6176J3QK59 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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Gm6176J3QK59 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6176J3QK59 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Gm6176J3QK59 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Gm6176J3QK59 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Gm6176J3QK59 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Gm6176J3QK59 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6176J3QK59 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6176J3QK59 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6176J3QK59 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6176J3QK59 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6176J3QK59 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6176J3QK59 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6176J3QK59 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6176J3QK59 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6176J3QK59 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6176J3QK59 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6176J3QK59 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6176J3QK59 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6176J3QK59 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6176J3QK59 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6176J3QK59 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6176J3QK59 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6176J3QK59 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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