Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms