Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms