Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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