Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Taf4bG5E8Z2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Taf4bG5E8Z2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Taf4bG5E8Z2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Taf4bG5E8Z2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Taf4bG5E8Z2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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