Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms