Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms