Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms