Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
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Rdh16f1E9Q9P8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Rdh16f1E9Q9P8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Rdh16f1E9Q9P8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Rdh16f1E9Q9P8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Rdh16f1E9Q9P8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Rdh16f1E9Q9P8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
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Rdh16f1E9Q9P8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Rdh16f1E9Q9P8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Rdh16f1E9Q9P8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Rdh16f1E9Q9P8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Rdh16f1E9Q9P8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Rdh16f1E9Q9P8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Rdh16f1E9Q9P8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Rdh16f1E9Q9P8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Rdh16f1E9Q9P8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Rdh16f1E9Q9P8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Rdh16f1E9Q9P8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh16f1E9Q9P8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
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