Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms