Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ccdc71lE9Q4T4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
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Ccdc71lE9Q4T4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ccdc71lE9Q4T4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ccdc71lE9Q4T4 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ccdc71lE9Q4T4 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ccdc71lE9Q4T4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ccdc71lE9Q4T4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ccdc71lE9Q4T4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ccdc71lE9Q4T4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms