Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms