Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms