Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms