Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim12cD3Z3L3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim12cD3Z3L3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim12cD3Z3L3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim12cD3Z3L3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim12cD3Z3L3 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms