Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms