Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms