Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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