Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppfia1B2RXQ2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms