Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol7aB2RT54 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms