Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms