Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms