Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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H2-M5A7VMS3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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H2-M5A7VMS3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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H2-M5A7VMS3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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