Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1jA2BFR3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms