Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms