Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms