Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0U1RNP2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms