Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3550W4VSN7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms