Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W8

Gria4, Glutamate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria4Q9Z2W8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gria4Q9Z2W8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gria4Q9Z2W8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gria4Q9Z2W8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gria4Q9Z2W8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gria4Q9Z2W8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gria4Q9Z2W8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gria4Q9Z2W8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gria4Q9Z2W8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gria4Q9Z2W8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gria4Q9Z2W8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gria4Q9Z2W8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gria4Q9Z2W8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gria4Q9Z2W8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gria4Q9Z2W8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gria4Q9Z2W8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms