Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbd1Q9Z2E2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbd1Q9Z2E2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbd1Q9Z2E2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbd1Q9Z2E2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mbd1Q9Z2E2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mbd1Q9Z2E2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms