Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Ap3b1Q9Z1T1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ap3b1Q9Z1T1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ap3b1Q9Z1T1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ap3b1Q9Z1T1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ap3b1Q9Z1T1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ap3b1Q9Z1T1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ap3b1Q9Z1T1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ap3b1Q9Z1T1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ap3b1Q9Z1T1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ap3b1Q9Z1T1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Ap3b1Q9Z1T1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ap3b1Q9Z1T1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ap3b1Q9Z1T1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ap3b1Q9Z1T1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ap3b1Q9Z1T1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ap3b1Q9Z1T1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ap3b1Q9Z1T1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Ap3b1Q9Z1T1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ap3b1Q9Z1T1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ap3b1Q9Z1T1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ap3b1Q9Z1T1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ap3b1Q9Z1T1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ap3b1Q9Z1T1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ap3b1Q9Z1T1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Ap3b1Q9Z1T1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ap3b1Q9Z1T1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ap3b1Q9Z1T1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ap3b1Q9Z1T1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ap3b1Q9Z1T1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ap3b1Q9Z1T1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ap3b1Q9Z1T1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ap3b1Q9Z1T1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ap3b1Q9Z1T1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ap3b1Q9Z1T1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ap3b1Q9Z1T1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ap3b1Q9Z1T1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ap3b1Q9Z1T1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ap3b1Q9Z1T1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ap3b1Q9Z1T1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ap3b1Q9Z1T1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ap3b1Q9Z1T1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ap3b1Q9Z1T1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ap3b1Q9Z1T1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ap3b1Q9Z1T1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ap3b1Q9Z1T1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ap3b1Q9Z1T1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ap3b1Q9Z1T1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ap3b1Q9Z1T1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ap3b1Q9Z1T1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ap3b1Q9Z1T1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Ap3b1Q9Z1T1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Ap3b1Q9Z1T1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
Ap3b1Q9Z1T1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Ap3b1Q9Z1T1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Ap3b1Q9Z1T1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Ap3b1Q9Z1T1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ap3b1Q9Z1T1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Ap3b1Q9Z1T1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Ap3b1Q9Z1T1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Ap3b1Q9Z1T1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ap3b1Q9Z1T1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Ap3b1Q9Z1T1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ap3b1Q9Z1T1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Ap3b1Q9Z1T1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ap3b1Q9Z1T1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
Ap3b1Q9Z1T1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Ap3b1Q9Z1T1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ap3b1Q9Z1T1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ap3b1Q9Z1T1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Ap3b1Q9Z1T1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Ap3b1Q9Z1T1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms