Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lgr5Q9Z1P4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lgr5Q9Z1P4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lgr5Q9Z1P4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lgr5Q9Z1P4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lgr5Q9Z1P4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lgr5Q9Z1P4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lgr5Q9Z1P4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lgr5Q9Z1P4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lgr5Q9Z1P4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lgr5Q9Z1P4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lgr5Q9Z1P4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Lgr5Q9Z1P4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lgr5Q9Z1P4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lgr5Q9Z1P4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Lgr5Q9Z1P4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Lgr5Q9Z1P4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Lgr5Q9Z1P4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Lgr5Q9Z1P4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lgr5Q9Z1P4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lgr5Q9Z1P4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lgr5Q9Z1P4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lgr5Q9Z1P4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lgr5Q9Z1P4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lgr5Q9Z1P4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lgr5Q9Z1P4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lgr5Q9Z1P4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lgr5Q9Z1P4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lgr5Q9Z1P4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Lgr5Q9Z1P4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Lgr5Q9Z1P4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lgr5Q9Z1P4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lgr5Q9Z1P4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lgr5Q9Z1P4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lgr5Q9Z1P4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lgr5Q9Z1P4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lgr5Q9Z1P4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lgr5Q9Z1P4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lgr5Q9Z1P4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lgr5Q9Z1P4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lgr5Q9Z1P4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lgr5Q9Z1P4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Lgr5Q9Z1P4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lgr5Q9Z1P4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lgr5Q9Z1P4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lgr5Q9Z1P4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lgr5Q9Z1P4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lgr5Q9Z1P4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lgr5Q9Z1P4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lgr5Q9Z1P4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lgr5Q9Z1P4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lgr5Q9Z1P4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Lgr5Q9Z1P4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lgr5Q9Z1P4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lgr5Q9Z1P4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lgr5Q9Z1P4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lgr5Q9Z1P4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lgr5Q9Z1P4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Lgr5Q9Z1P4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lgr5Q9Z1P4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lgr5Q9Z1P4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lgr5Q9Z1P4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lgr5Q9Z1P4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lgr5Q9Z1P4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms