Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfrp4Q9Z1N6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sfrp4Q9Z1N6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sfrp4Q9Z1N6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfrp4Q9Z1N6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfrp4Q9Z1N6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfrp4Q9Z1N6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfrp4Q9Z1N6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfrp4Q9Z1N6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfrp4Q9Z1N6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfrp4Q9Z1N6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfrp4Q9Z1N6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfrp4Q9Z1N6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfrp4Q9Z1N6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfrp4Q9Z1N6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfrp4Q9Z1N6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfrp4Q9Z1N6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfrp4Q9Z1N6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfrp4Q9Z1N6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfrp4Q9Z1N6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfrp4Q9Z1N6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfrp4Q9Z1N6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfrp4Q9Z1N6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfrp4Q9Z1N6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfrp4Q9Z1N6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfrp4Q9Z1N6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms