Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema4fQ9Z123 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema4fQ9Z123 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema4fQ9Z123 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema4fQ9Z123 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema4fQ9Z123 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema4fQ9Z123 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema4fQ9Z123 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema4fQ9Z123 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema4fQ9Z123 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema4fQ9Z123 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema4fQ9Z123 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema4fQ9Z123 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema4fQ9Z123 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema4fQ9Z123 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema4fQ9Z123 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema4fQ9Z123 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema4fQ9Z123 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema4fQ9Z123 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema4fQ9Z123 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema4fQ9Z123 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema4fQ9Z123 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema4fQ9Z123 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema4fQ9Z123 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema4fQ9Z123 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema4fQ9Z123 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema4fQ9Z123 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema4fQ9Z123 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema4fQ9Z123 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema4fQ9Z123 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema4fQ9Z123 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema4fQ9Z123 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema4fQ9Z123 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema4fQ9Z123 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema4fQ9Z123 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema4fQ9Z123 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema4fQ9Z123 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema4fQ9Z123 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema4fQ9Z123 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema4fQ9Z123 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema4fQ9Z123 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema4fQ9Z123 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema4fQ9Z123 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema4fQ9Z123 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema4fQ9Z123 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema4fQ9Z123 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema4fQ9Z123 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema4fQ9Z123 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema4fQ9Z123 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema4fQ9Z123 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema4fQ9Z123 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema4fQ9Z123 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema4fQ9Z123 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema4fQ9Z123 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema4fQ9Z123 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema4fQ9Z123 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema4fQ9Z123 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema4fQ9Z123 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema4fQ9Z123 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema4fQ9Z123 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema4fQ9Z123 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema4fQ9Z123 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema4fQ9Z123 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema4fQ9Z123 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema4fQ9Z123 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms