Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pmfbp1Q9WVQ0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pmfbp1Q9WVQ0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pmfbp1Q9WVQ0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pmfbp1Q9WVQ0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pmfbp1Q9WVQ0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pmfbp1Q9WVQ0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pmfbp1Q9WVQ0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pmfbp1Q9WVQ0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pmfbp1Q9WVQ0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pmfbp1Q9WVQ0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pmfbp1Q9WVQ0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pmfbp1Q9WVQ0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pmfbp1Q9WVQ0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pmfbp1Q9WVQ0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pmfbp1Q9WVQ0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pmfbp1Q9WVQ0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pmfbp1Q9WVQ0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pmfbp1Q9WVQ0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pmfbp1Q9WVQ0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pmfbp1Q9WVQ0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pmfbp1Q9WVQ0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pmfbp1Q9WVQ0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pmfbp1Q9WVQ0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pmfbp1Q9WVQ0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pmfbp1Q9WVQ0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pmfbp1Q9WVQ0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Pmfbp1Q9WVQ0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pmfbp1Q9WVQ0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pmfbp1Q9WVQ0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pmfbp1Q9WVQ0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pmfbp1Q9WVQ0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pmfbp1Q9WVQ0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pmfbp1Q9WVQ0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pmfbp1Q9WVQ0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pmfbp1Q9WVQ0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pmfbp1Q9WVQ0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pmfbp1Q9WVQ0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pmfbp1Q9WVQ0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pmfbp1Q9WVQ0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pmfbp1Q9WVQ0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pmfbp1Q9WVQ0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pmfbp1Q9WVQ0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms