Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF8

Tusc2, Tumor suppressor candidate 2, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tusc2Q9WVF8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tusc2Q9WVF8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tusc2Q9WVF8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tusc2Q9WVF8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tusc2Q9WVF8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tusc2Q9WVF8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tusc2Q9WVF8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tusc2Q9WVF8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tusc2Q9WVF8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tusc2Q9WVF8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tusc2Q9WVF8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tusc2Q9WVF8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tusc2Q9WVF8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tusc2Q9WVF8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tusc2Q9WVF8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tusc2Q9WVF8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tusc2Q9WVF8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tusc2Q9WVF8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tusc2Q9WVF8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tusc2Q9WVF8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tusc2Q9WVF8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tusc2Q9WVF8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tusc2Q9WVF8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tusc2Q9WVF8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tusc2Q9WVF8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tusc2Q9WVF8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tusc2Q9WVF8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tusc2Q9WVF8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tusc2Q9WVF8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tusc2Q9WVF8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tusc2Q9WVF8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 233.9 ms