Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pfdn5Q9WU28 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pfdn5Q9WU28 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pfdn5Q9WU28 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pfdn5Q9WU28 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pfdn5Q9WU28 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pfdn5Q9WU28 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pfdn5Q9WU28 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pfdn5Q9WU28 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pfdn5Q9WU28 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pfdn5Q9WU28 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms