Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubd1Q9R1K7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubd1Q9R1K7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubd1Q9R1K7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubd1Q9R1K7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubd1Q9R1K7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms