Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc26a4Q9R155 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc26a4Q9R155 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc26a4Q9R155 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc26a4Q9R155 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc26a4Q9R155 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc26a4Q9R155 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc26a4Q9R155 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc26a4Q9R155 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc26a4Q9R155 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc26a4Q9R155 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc26a4Q9R155 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slc26a4Q9R155 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slc26a4Q9R155 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc26a4Q9R155 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc26a4Q9R155 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Slc26a4Q9R155 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc26a4Q9R155 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms