Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Plod1Q9R0E2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms