Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fhl3Q9R059 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.5 ms