Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphs1Q9QZS7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nphs1Q9QZS7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphs1Q9QZS7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphs1Q9QZS7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphs1Q9QZS7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphs1Q9QZS7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphs1Q9QZS7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphs1Q9QZS7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphs1Q9QZS7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphs1Q9QZS7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphs1Q9QZS7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphs1Q9QZS7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphs1Q9QZS7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphs1Q9QZS7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphs1Q9QZS7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphs1Q9QZS7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphs1Q9QZS7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphs1Q9QZS7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphs1Q9QZS7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphs1Q9QZS7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphs1Q9QZS7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphs1Q9QZS7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphs1Q9QZS7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphs1Q9QZS7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphs1Q9QZS7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms